عدم وجود اشیا و اسناد تاریخی، عدم مبلمان مناسب، کمبود نیروی انسانی و متخصص موزه، محدود شدن فعالیت آن به ساعات اداری و عدم فعالیت آن در روزهای تعطیل و ساعات عصر و غروب، نبود تابلوهای راهنمایی و مسیریابی، فقدان تبلیغات، عدم برگزاری نشست های تخصصی و تاریخی در این محل و… از جمله این مشکلات و کمبودهای این مرکز بوده که بهتر است فکری اساسی برای حل آن اندیشیده شود.

مسئولان میراث فرهنگی سقز و کوردستان باید بدانند صرف رفع تکلیف در شان تاریخ و جایگاه سقز نیست و باید موزه ای ترکیبی و بزرگ تر در سقز راه اندازی شود.