بخش صنعت، معدن و تجارت با مسائل و مشکلات متعددی مواجه است که از جمله آنها می توان به ضعف شدید نقدینگی و سرمایه در گردش واحدهای تولیدی، بوروکراسی پیچیده اداری و بانک ها فراروی تولید و تجارت، عدم ثبات و پیش‌بینی‌ناپذیری متغیرهای اقتصادی و قوانین و مقررات، پایین بودن بهره‌وری، تورم بالا، پیروی قیمت‌های داخلی از ارزهای خارجی، مشکلات تامین مواد اولیه، سهم قابل توجه تجارت غیر رسمی و قاچاق، محدودیت در زیرساخت‌ها نظیر زمین مناسب، برق، گاز و آب، بازدهی بالای بازارهای غیرمولد و هدایت نقدینگی به این بازارها، عدم توازن سرمایه‌گذاری در رشته فعالیت‌ها و مناطق، پایین بودن سطح تحقیق و توسعه در فعالیت‌های تولیدی و… اشاره نمود

عدم ارتباط صاحبان ایده، واحدهای فناور و شرکت های دانش بنیان با سرمایه گذاران بخش خصوصی، عدم وجودشهرک های فناور و دانش بنیان در شهرستان هایی مانند سقز، نبود صنایع مادر و به تبع آن ایجاد خوشه های صنعتی، عدم سرمایه گذاری شرکت های مادر و هلدیتنگ های سرمایه گذاری در بخش تولید در منطقه، سخت گیری و اهمال بانک های عامل در ارائه خدمات پولی و بانکی، وثیقه های سنگین بانکی، خام فروشی معادن و تبعات زیست محیطی و اجتماعی ناشی از آن، عدم آشنایی با بازاریابی نوین، کم توجهی به مقوله برندینگ و تبلیغات، افزایش بالای حق بیمه و مالیات موارد دیگری است که در این حوزه می توان به آن اشاره نمود.

در کنار موارد فوق، عدم بازگشایی بازارچه مرزی سقز، عدم ایجاد مناطق ویژه اقتصادی و آزادی تجاری در این شهرستان مرزی، ایجاد منطقه ویژه اقتصادی مشترک با شرکای خارجی و… موارد دیگریست که امکان جذب سرمایه گذاری های کلان بخش خصوصی و خارجی را با محدودیت ایجاد کرده است.

به نظر می رسد برنامه ریزی و تدوین استراتژی هایی برای ایجاد صنایع مادر و سرمایه گذاری های کلان توسط شرکت هایی مانند شستا و هلدینگ های وابسته، شرکت های پتروشیمی، ذوب آهن، کارخانجات سیلیس و…، توسعه زیرساخت‌های شهرک صنعتی، فعال کردن واحدهای غیر فعال، ایجاد شهرک های صنوف مزاحم و آلاینده، اختصاص سرمایه در گردش و تامین نقدینگی لازم با سود پایین برای واحدهای صنعتی، تخفیف های مالیاتی و ارائه مشوق های مالیاتی و تسهیلاتی برای سرمایه گذاری های صنعتی در مناطق محروم، تعامل سازنده بانک ها با صنعتگران و تولیدکنندگان جهت رونق کسب و کار، افزایش اختیارات ادارات شهرستان های ویژه و تمرکز زدایی اداری و کاهش بروکراسی برای حل مشکلات اداری در حوزه تولید و صنعت، ارتقای زیرساخت های مخابراتی، اینترنت، برق، گاز و آب، استقرار گمرک و بازگشایی بازارچه مرزی شهرستان سقز، تامین سرمایه در گردش، تسهیل گری در حوزه تجارت و صادرات، حل معضل فاضلاب و ایجاد تصفیه خانه های مدرن برای شهرک های صنعتی، راه اندازی منطقه ویژه اقتصادی و الحاق سقز به منطقه آزاد تجاری، بهره گیری مناسب تر از معادن، تسریع در راه اندازی کارخانه ذوب آهن و ایجاد صنایع پایین دستی، تقویت حوزه های فنی و حرفه ای برای جذب جوانان و ایجاد کارگاه های کوچک، ایجاد صنایع تبدیلی در حزوه کشاورزی و دامی، توجه به کارآفرینان و ایده پردازان، افزایش ظرفیت کارخانه های ساخت کالاهای سرمایه ای، به‌کارگیری فناوری‌های جدید و سرمایه گذاری بر روی آنها، ضرورت توجه بیشتر به بازارچه های رسمی برای صادرات کالا از جمله بازگشایی بازارچه مرزی سقز، ایجاد فضای امن سرمایه گذاری برای خارجی ها و سرمایه گذاران داخلی، ایجاد منطقه ویژه اقتصادی مشترک با شرکای خارجی، ورود تکنولوژی های جدید، راه اندازی پارک های علم و فناوری در شهرستان ها و… باید مورد توجه جدی قرار گیرد.